Introducción a las Ciencias Ómicas

Fecha evento: 
11/07/2022 al 14/07/2022
Coordinación: 

Laura Grasa López, Profesora Titular, Universidad de Zaragoza

Presencial
Horas lectivas totales: 
16.00h.
Horas lectivas presenciales: 
16.00h.
Tarifa general: 
120 euros
Tarifa reducida: 
100 euros

Objetivos: 

El curso es una introducción al conocimiento de las principales ciencias ómicas que se están utilizando en la actualidad para el análisis de datos en genómica, metagenómica, transcriptómica y proteómica. Se describirá el concepto de las diferentes ciencias ómicas, se expondrán sus principales aplicaciones y se realizarán algunas prácticas con algunas herramientas bioinformáticas que se utilizan en las diferentes ciencias ómicas. Durante estas prácticas, se analizarán datos con ejemplos concretos de experimentos realizados en el laboratorio y que se pueden analizar utilizando diferentes herramientas bioinformáticas.

El objetivo del curso es acercar el conocimiento de las ciencias ómicas a los estudiantes e investigadores que tengan un interés por aplicar estas herramientas a su actual o futura actividad investigadora o profesional.

Programa: 

Lunes, 11 de Julio
09:00 h. Introducción a las Ciencias Ómicas. [1]
10:00 h. Introducción al análisis de asociación de genoma completo (GWAS). Diseño experimental y fenotipado. [4]
11:30 h. Análisis GWAS. Importación y filtrado de calidad de los datos de genotipado. Imputación de genotipos faltantes. [4]
12:30 h. Análisis GWAS. Análisis de asociación de genoma completo caso/control y cuantitativo. Anotación de genes y análisis de enriquecimiento funcional. [4]

Martes, 12 de Julio
09:00 h. Introducción a la secuenciación de RNA (RNA-Seq) y a la plataforma Galaxy. [3]
10:00 h. Análisis de datos de RNA-Seq con Galaxy. Importación de datos. Análisis de calidad de las secuencias. Trimming. [3]
11:30 h. Análisis de datos de RNA-Seq con Galaxy. Alineación de lecturas con el genoma. El recuento de lecturas para cada gen. [3]
12:30 h. Análisis de datos de RNA-Seq con Galaxy. Creación de un flujo de trabajo computacional. Búsqueda de genes expresados diferencialmente. [3]

Miércoles, 13 de Julio
09:00 h. Introducción a la metagenómica. Análisis de la microbiota intestinal. [5]
10:00 h. Análisis de microbiota con QIIME2. Importación de datos. Análisis de calidad de las secuencias. [5]
11:30 h. Análisis de microbiota con QIIME2. Filtrado de las secuencias. Obtención de ASVs. [5]
12:30 h. Análisis de microbiota con QIIME2. Anotación taxonómica de las secuencias utilizando la base de datos Greengenes. Composición taxonómica de las bacterias. [5]

Jueves, 14 de Julio
09:00 h. Introducción a la proteómica. [2]
10:00 h. Herramientas proteómicas para búsqueda de biomarcadores. [2]
11:30 h. Construcción de genomas bacterianos (Whole Genome sequencing). [1]

Ponentes: 

1 Inmaculada Martín Burriel, Catedrática, Universidad de Zaragoza
2 Irene Orera Utrilla, Responsable del Servicio Proteómica. Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud (IACS)
3 Janne Markus Toivonen, Profesor Contratado Doctor Investigador
4 Jorge Hugo Calvo Lacosta, Investigador ARAID. Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón (CITA)
5 Laura Grasa López, Profesora Titular, Universidad de Zaragoza

Alumnado: 

- Estudiantes de último curso de los Grados del área de Ciencias o Biomédicas: Biotecnología, Veterinaria, Medicina, etc.
- Estudiantes de Máster o de Doctorado relacionados con las áreas anteriores.
- Investigadores que estén interesados en introducirse en las ciencias ómicas.

Reconocimiento de créditos: 

Solicitado el reconocimiento como créditos por las Actividades universitarias culturales por la Universidad de Zaragoza.

0,5 ECTS

1. Los asistentes pueden solicitar individualmente a los Servicios Provinciales de Educación el reconocimiento de la actividad como Formación Permanente de Profesorado presentando el certificado de haber realizado el curso.

2. Reconocimiento como créditos ECTS en el Grupo 9 de Universidades (G-9): Más información en https://cursosextraordinarios.unizar.es/ (Apartado créditos).

3. Créditos ECTS en otras universidades.

Los estudiantes interesados en que su Universidad les reconozca como créditos ECTS por haber realizado un Curso de Verano de la Universidad de Zaragoza, deben consultar con la Secretaría de su Facultad o Escuela de origen tal posibilidad.

Lugar de celebración: 

Universidad de Zaragoza
Aula de Informática
Facultad de Veterinaria