Spectroscopic and computational methods towards molecular structure and reactivity
Inés García Rubio, Profesora Contratada Doctora del Centro Universitario de la Defensa/ Patricia Ferreira Neila, Profesora Contratada Doctora de la Universidad de Zaragoza/ Juan Fernández-Recio, Científico Titular CSIC. Barcelona Supercomputing Center. Instituto de ciencias de la vid y el vino, Logroño.
Matrículas becadas por la Fundación General CSIC.
The school will cover the basic principles of theoretical chemistry with an emphasis on different spectroscopic methods that provide data on the structure of complex molecules. An overview of theoretical and computational methods, which are essential to interpretation of the experimental data, will be a central part of the content. The way experiments and theory complement and help each other’s development will be stressed and illustrated with examples and practical cases, prominently biomolecules and molecules with catalytic potential.
The aim of the school is to train the students on which spectroscopic methods can provide what sort of information and which computational technique would be more suitable to simulate the system.
The topics will include:
- Optical absorption spectroscopy
- Optical emission spectroscopy
- Circular dichroism
- Infrared and Raman spectroscopy
- Nuclear Magnetic Resonance
- X-ray Absorption Spectroscopy
- Molecular dynamics / docking
- Density Functional Theory
- Ab initio calculations (QM/MM)
- Montecarlo methods
A workshop on life-cycle analysis will precede this course.
Lunes, 19 de Julio
- 09:00 h. General introduction. Fundamentals of Spectroscopy. [11]
- 10:00 h. Metal ion energy-level calculations [6]
- 12:00 h. UV-VIS absorption spectroscopy. [12]
- 15:00 h. Emission spectroscopy [11]
- 17:00 h. Students assignment. [12] [4]
Martes, 20 de Julio
- 09:00 h. Circular Dichroism in biotechnology [13]
- 10:30 h. Infrared and Raman spectroscopy. [15]
- 12:00 h. Nuclear Magnetic Resonance. [14]
- 15:00 h. Experimental determination of biomolecular structures by X-ray crystallization technique. [10]
- 17:00 h. Experimental Session [11] [10]
Miércoles, 21 de Julio
- 09:00 h. Fundamentals of X-ray Absorption Spectroscopy [3]
- 10:30 h. Mössbauer spectroscopy. [9]
- 12:00 h. Application of spectroscopic methods to investigate heterogeneous catalysts. [15]
- 15:00 h. Students assignment [4] [9]
Jueves, 22 de Julio
- 09:00 h. Introduction to the many-electron problem. [1]
- 10:30 h. DFT(Density Functional Theory). [1]
- 12:00 h. Multiconfigurational and perturbative methods. [5]
- 15:00 h. Simulation Session [17] [8]
Viernes, 23 de Julio
- 09:00 h. Fundamentals of Molecular Mechanics (MM). [16]
- 10:30 h. Docking Techniques. [7]
- 12:00 h. Computational methods to study chemical reactivity in biological systems [16]
- 15:00 h. Simulation Session. [16] [8]
Sábado, 24 de Julio
- 09:00 h. Ab initio modeling of periodic systems: models, strategies and applications. [2]
- 10:30 h. Student Session.
- 12:00 h. Final sesion, closing of the school and feedback from students.
1 Alberto Castro Barrigón, Investigador ARAID. Instituto de Física de Sistemas Complejos y Biocomputación de la Universidad de Zaragoza.
2 Bartolomeo Civalleri, Università degli studi di Torino, Italia
3 Giovanni Agostini
4 Inés García Rubio, Profesora Contratada Doctora del Centro Universitario de la Defensa
5 Javier Luzón Marco, Profesor Contratado Doctor. Centro Universitario de la Defensa, Zaragoza.
6 Jesús Martínez Martínez, Profesor Titular de la Universidad de Zaragoza
7 Juan Fernández-Recio, Científico Titular CSIC. Barcelona Supercomputing Center. Instituto de ciencias de la vid y el vino, Logroño.
8 Juan José Galano Frutos, Colaborador Extraordinario.
9 Maria Fittipaldi, Profesora de Universidad. Universita di Firenze, Florencia.
10 Marta Martínez Júlvez, Profesora Titular de la Universidad de Zaragoza
11 Milagros Medina Truyenque, Catedrática de la Universidad de Zaragoza
12 Patricia Ferreira Neila, Profesora Contratada Doctora de la Universidad de Zaragoza
13 Paul Georg Fürtmüller, Universitätsdozent. Universität für Bodenkultur, Viena.
14 Ricardo Louro, Investigador Auxiliar com Agregação. Universidade Nova de Lisboa.
15 Silvia Bordiga, Catedrática. Universita di Torino, Turín.
16 Vicente Moliner, Catedrático de la Universitat Jaume I, Valencia.
17 Víctor Polo Ortiz, Profesor Titular de la Universidad de Zaragoza
The school is aimed at PhD students, but it could also fit the level and interest of master students and recent postdocs from a broad range of backgrounds such as catalysis, biophysics, coordination chemistry, biocatalysis, etc, that want to broaden their scope and enrich their skills with a training in molecular simulations and spectroscopic techniques.
Solicitado el reconocimiento como créditos por las Actividades universitarias culturales por la Universidad de Zaragoza.
1,5 ECTS
1. Los asistentes pueden solicitar individualmente a los Servicios Provinciales de Educación el reconocimiento de la actividad como Formación Permanente de Profesorado presentando el certificado de haber realizado el curso.
2. Reconocimiento como créditos ECTS en el Grupo 9 de Universidades (G-9): Más información en https://cursosextraordinarios.unizar.es/ (Apartado créditos).
3. Créditos ECTS en otras universidades.
Los estudiantes interesados en que su Universidad les reconozca como créditos ECTS por haber realizado un Curso de Verano de la Universidad de Zaragoza, deben consultar con la Secretaría de su Facultad o Escuela de origen tal posibilidad.
Dentro de las actividades programadas para este curso se encuentran sesiones en las que los estudiantes tendrán que preparar y dar presentaciones orales relacionadas con los contenidos del curso. Además, tendrán lugar sesiones de prácticas y puesta en común de casos prácticos. Durante estas actividades, el desempeño de los alumnos que quieran el reconocimiento de créditos ECTS será evaluado por el elenco de profesores.
Salón de Actos del Instituto de Biocomputación y Física de Sistemas Complejos.
Campus Río Ebro
Calle de Mariano Esquillor Gómez, Edificio I+D,
50018 Zaragoza
